元昌没有丝毫的抵抗，被北周的士兵按到之后，说出来自己的身份。听到被抓住的是出家的北齐皇族之后，带队的军官大喜。当下将元昌关在了大牢当中，等着北周皇帝下圣旨如何处置这个和尚。
听到抓住高僧元昌之后，北周上层也是十分惊讶。当初这位圣僧的传说遍布天下，虽然经过了这么多年，传说的反而起来越神。后来传说是北齐后主高纬嫉贤妒能，暗中杀害了元昌。想不到这和尚非但反而一直都藏匿在皇宫当中。
不过如何处置这个和尚北周皇帝却有些为难，按理说北齐皇族已经死的差不多，也不差这一个了。不过当时佛教昌盛元昌的名气有太大，北周皇族也信奉佛教。担心元昌死在自己手里的话会引起佛祖的怪罪，一时半会也没有处置元昌和尚的主意。
最后还是大丞相杨坚出的主意，既然杀不得那就放了吧。现在北齐已经灭亡，只是一个和尚翻不了天的。于是，被关押了数日的元昌被从天牢里面放了出来，安置在洛阳城中的云中寺庙当中。
元昌的名头实在太响，自从到了云中寺之后，不停的有北周的高官、富商和百姓前来恭听元昌说法。见到好好的一座清净禅林变得喧闹起来。元昌无奈之下从云中寺当中离开，开始在北朝各地的寺庙当中游方起来。趁着那个封印自己的人还没有赶到，他将自己少年时期在问天楼学得那些纵神弄鬼的术法一一记录在案，竟然编写出来一本叫做《鬼神经》的密集。
一直在暗中监视元昌的归不归看着元昌写的术法都是一些不紧要的，当下也不在意。问天楼已经倒塌了几百年，能把楼中的术法记录下来也没有什么大碍。看着元昌现在的样子，彷佛在靠写书消磨时间，等着那个封印他的人前来了。
不过好日子过了没有多久，北周国都长安城中突然传来了一个北齐皇族要谋反重夺天下的谣传。当时北周正在南征，要看着就要一统天下的时侯当然出不得这种纰漏。当下大丞相杨坚派人再次将元昌抓了起来，关押在大牢严刑拷问。